A Igreja Presbiteriana do Brasil é a mais antiga denominação reformada do país, tendo sido fundada pelo missionário Ashbel Green Simonton (1833-1867), que aqui chegou em 1859. Mais tarde, ao longo do século 20, surgiram outras igrejas congêneres que também se consideram herdeiras da tradição calvinista. Elas são as seguintes, por ordem cronológica de organização: Igreja Presbiteriana Independente do Brasil (1903); Igreja Presbiteriana Conservadora (1940); Igreja Presbiteriana Fundamentalista (1956); Igreja Presbiteriana Renovada do Brasil (1975) e Igreja Presbiteriana Unida do Brasil (1978).
1. Igreja Presbiteriana Independente do Brasil
Surgiu em 1903 como uma denominação totalmente nacional, sem vinculação com igrejas estrangeiras. Resultou do projeto nacionalista do Rev. Eduardo Carlos Pereira (1856-1923), que entrou em conflito com o Sínodo da IPB em torno das questões missionária, educacional e maçônica. Em 1907, a IPI tinha 56 igrejas e 4.200 membros comungantes. Fundou um seminário em São Paulo. Em 1908 foi instalado o seu Sínodo, inicialmente com três presbitérios; em 1957 foi criado o Supremo Concílio, com três sínodos, dez presbitérios, 189 igrejas locais e 105 pastores. O Estandarte, fundado em 1893, é até hoje o jornal oficial. Após o Congresso do Panamá (1916), a IPI aproximou-se da IPB e das outras igrejas evangélicas. A partir de 1930, surgiu um movimento de intelectuais (entre eles o Rev. Eduardo Pereira de Magalhães, neto de Eduardo C. Pereira) que pretendia reformar a liturgia, certos costumes eclesiásticos e até mesmo a Confissão de Fé. A questão eclodiu no Sínodo de 1938. Um grupo organizou a Liga Conservadora, liderada pelo Rev. Bento Ferraz. A elite liberal retirou-se da IPI em 1942 e formou a Igreja Cristã de São Paulo. Ver http://www.ipib.org
2. Igreja Presbiteriana Conservadora
Foi fundada em 11.02.1940 pelos membros da Liga Conservadora da IPI, sob a liderança do Rev. Bento Ferraz. Outros líderes conhecidos foram o Dr. Flamínio Fávero, o Rev. Rafael Pages Camacho, ex-pastor da 2ª I. P. Independente de São Paulo, e o Rev. Francisco Augusto Pereira Júnior. Em 1957, contava com mais de vinte igrejas, em quatro estados, e tinha um seminário em Riacho Grande, município de São Bernardo do Campo. Seu órgão oficial é O Presbiteriano Conservador (1940). Por alguns anos foi filiada à Aliança Latino-Americana de Igrejas Cristãs e à Confederação de Igrejas Evangélicas Fundamentalistas do Brasil. Hoje tem cerca de cinquenta igrejas e congregações autônomas, em dez estados da federação. Sua sede nacional está localizada em São Paulo. Ver http://www.ipcb.org.br
3. Igreja Presbiteriana Fundamentalista
Na década de 1950, Israel Furtado Gueiros, pastor da histórica 1ª Igreja Presbiteriana de Recife (1878) e ligado ao Concílio Internacional de Igrejas Cristãs, fundado por Carl McIntire, liderou uma campanha contra o Seminário do Norte sob a acusação de modernismo. Gueiros fundou outro seminário e foi deposto pelo Presbitério de Pernambuco em julho de 1956. Em 21 de setembro do mesmo ano foi organizada a IPFB com quatro igrejas locais (incluindo elementos batistas e congregacionais), que formaram um presbitério com 1800 membros. A pequena denominação tem igrejas no Nordeste, na Amazônia e umas poucas no sul do país. Há alguns anos, a igreja-mãe de Recife retornou à IPB.
4. Igreja Presbiteriana Renovada do Brasil
Em 1968, como resultado do “movimento de renovação” na IPB, surgiu em Cianorte, no norte do Paraná, a Igreja Cristã Presbiteriana. Em 1972, um segmento separou-se da IPI para formar a Igreja Presbiteriana Independente Renovada, em Assis, São Paulo. Em 1975, os dois grupos se uniram, criando a Igreja Presbiteriana Renovada do Brasil. Ver http://www.iprb.org.br
5. Igreja Presbiteriana Unida do Brasil
Foi fundada por elementos que discordaram da postura conservadora da IPB durante a administração do Rev. Boanerges Ribeiro (1966-1978). Surgiram dois grupos dissidentes. Em 1974, membros do Presbitério de São Paulo criaram a Aliança de Igrejas Reformadas. Em 1978, foi criada a Federação Nacional de Igrejas Presbiterianas (FENIP), em Atibaia. Em 1983, na cidade de Vitória, a FENIP adotou o nome de Igreja Presbiteriana Unida do Brasil. Essa igreja abraça uma postura teológica progressista, pluralista e ecumênica. Ver http://www.ipu.org.br
Além destas, existem no Brasil, principalmente em São Paulo, diversas igrejas presbiterianas coreanas e chinesas, bem como igrejas que se denominam reformadas, como as Igrejas Evangélicas Reformadas do Brasil (IERB), de origem holandesa, que alcançaram sua autonomia em 1962.